在這樣的形勢下，“上海五國”一致認為，已有的會晤機制已不能適應地區與多邊合作的需要。2000年7月5日，“上海五國”元首在塔吉克斯坦首都杜尚別舉行第五次會晤，并簽署《杜尚別聲明》。烏茲別克斯坦總統卡里莫夫列席了會議，并正式提出參加“上海五國”元首會晤機制的申請。各國元首一致表達了將元首會晤機制發展成為區域性多邊合作組織的共同愿望。2001年6月15日，上海合作組織在中國上海宣告成立。

　　國際問題專家認為，“上海五國”機制到上合組織的發展過程，是當代國際關系中一次重要的外交實踐。它首倡了以互信、裁軍與安全合作為內涵的新型安全觀，豐富了以結伴而不結盟為核心的新型國家關系，提供了以大小國家共同倡導、安全先行、互利協作為特征的新型區域合作模式。它所培育出來的“互信、互利、平等、協商，尊重多樣文明，謀求共同發展”的“上海精神”，不僅是成員國處理相互關系的經驗總結，而且對推動建立公正合理的國際政治、經濟新秩序具有重要的現實意義。

　　當今世界，國際局勢總體上繼續趨向緩和，但人類生存安全面臨著新的挑戰與威脅。環境污染、貧困、販毒、難民等全球性問題日益突出；恐怖主義、分裂主義和極端主義“三股勢力”的破壞有增無減。為了解決共同面對的問題和應對新的挑戰，各國各地區加快了區域合作的步伐。上海合作組織的建立，也正是順應了這一時代潮流。

　　讓人意想不到的是，在上海合作組織正式成立后不到3個月的時間里，“911”事件爆發。國際反恐聯盟在阿富汗展開的軍事行動，引發了中亞地區地緣政治形勢急劇變化，上海合作組織的正常發展環境受到嚴重沖擊。加強上海合作組織內部的機制化建設，協調各國對世界和地區形勢發展、變化的基本立場，提高在地區安全等重要領域中的合作效率，成為亟待認真解決的問題。

　　2002年6月，上海合作組織成員國第二次元首峰會在俄羅斯的圣彼得堡舉行，6個國家的領導人簽署了《上海合作組織憲章》、《關于地區反恐怖機構的協定》和《上海合作組織成員國元首宣言》三份重要法律、政治文件。這是上海合作組織加強自身建設、提升合作層次、加大反恐力度所采取的三大戰略舉措。文件標志著該組織從國際法意義上得以真正建立。

　　上合組織成立5年來，各成員國在軍事、安全、司法、經貿、文化等各領域和各層次的合作相繼展開。當前，上合組織的活動涵蓋國際合作的主要領域，包括維護中亞地區的和平、穩定和安全；應對新挑戰和新威脅，首先是打擊恐怖主義、分裂主義、極端主義、非法販運毒品和武器、跨國犯罪；發展經濟、科技和文教合作，改善人民生活和提高生活質量，解決非法移民問題；加強政治合作，就重大國際和地區問題舉行磋商和協調立場等。上合組織合作范圍和深度取得了長足的進展。

　　首先，解決了歷史遺留的邊界問題。本著互信互讓、和平共處的精神，經過多年談判，在“上海五國”會晤機制和上海合作組織的框架內，中俄、中哈、中吉、中塔先后解決了中國西部邊界的遺留問題。2004年10月，俄羅斯總統普京訪華時中俄雙方簽署《關于中俄國界東段的補充協定》，使中俄第一次以法律形式明確標示出兩國完整的邊界線。邊界問題的解決，為成員國之間發展多領域各層次的睦鄰友好合作奠定了堅實基礎。

　　其次，在安全領域開展了卓有成效的合作，維護了本地區形勢的整體穩定。“911”事件后，上海合作組織成員國加強了以打擊本地區恐怖主義、極端主義和分裂主義“三股勢力”為中心的反恐合作，進一步增強了成員國間的相互信任。

　　上海合作組織是最早打出反恐旗幟的國際組織之一，在協調各國反恐合作方面發揮了重要作用。在成立之日，六國元首就簽署了《打擊恐怖主義、分裂主義和極端主義上海公約》，后來又在塔什干設立了地區反恐怖機構。在上海合作組織的框架內，各成員國在開展情報交流、司法協助等方面進行了卓有成效的合作，已舉行了3次聯合軍事演習。今年的3月29日，上海合作組織地區反恐機構理事會第六次會議在烏茲別克斯坦首都塔什干舉行，與會代表簽署了15份文件，其中包括《2007-2009年上海合作組織成員國在打擊恐怖主義、分裂主義和極端主義領域的合作綱要》。4月26日，上海合作組織成員國國防部長會議在中國北京舉行，部長們商定2007年在俄羅斯聯邦境內舉行下一次聯合反恐軍事演習。為協調演習組織和實施的相關問題，決定成立上海合作組織成員國國防部專家組。

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