屬于三江源地區的青海玉樹是中國著名的藏獒養育地，其異常高大威猛，因此上千只鐵鏈栓養的藏獒在強烈地震時無法逃生而死去。防疫人員4月中下旬一直在廢墟里密集搜尋集中大批藏獒和其他死亡動物遺體。此舉無害化處理要求比較高，掩埋必須達到一定深度，人工完成難度很大。

　　三江源自然保護區的18個核心區域中，有10個位于玉樹州境內，占總面積的72%，防疫須使用滅菌效果好、對環境無污染的消毒劑。否則，三江源生態屏障將面臨環保危機。