11月11日下午4點半，特偵組向法院申請羈押陳水扁，銬上手銬的這一刻起，代表的不是結束，一場司法審訊的馬拉松，才剛剛開始。

　　從特偵組到臺北地方法院沿途，媒體、警方早就布下重兵，晚上8點召開羈押庭,10點左右，特偵組突然向媒體調畫面，因為陳水扁在庭上控訴，說踏出特偵組時，有法警打傷他，合議庭法官緊急磋商半小時，裁定將陳水扁送到臺大醫院驗傷。

　　媒體和警方也往醫院集結，力挺陳水扁的民意代表，早已經等候在臺大醫院。

　　光是等到驗傷結束，趕回臺北地院，就耗費了1個半小時，此時早已過午夜，中斷了近3個小時的羈押庭，終于又展開了。

　　將近11個小時的庭訊，在12日清晨5點半劃下句點，合議庭3位法官，經過1個半小時的投票討論，7點05分，以2比1，裁定收押禁見，這一刻起，陳水扁淪為編號2630的階下囚。

　　8點28分，陳水扁抵達臺北看守所，神情一臉落寞。庭審從11日橫跨到12日，史無前例，長達近15個小時，其曲折動蕩的過程，創下臺灣又一項紀錄。