毛澤東對社教運動中的一些提法和做法提出了尖銳批評，指責“有人搞獨立王國，尾巴翹得很高”，還談到黨內有產生修正主義的危險。

　　薄一波后來回憶說：“黨內高層領導中發生的這些思想分歧，影響是深遠的。最嚴重的是使毛主席產生了對少奇同志的不信任，從而埋下了發動‘文化大革命’的種子。”

　　1964年12月15日至1965年1月14日，中共中央政治局在北京召開工作會議，總結前一階段社會主義教育運動的經驗，部署下一階段的工作。就在這次會議上，毛澤東和劉少奇對社教運動的看法出現了嚴重分歧。

　　12月15日下午，中央工作會議召開全體會議。會議由毛澤東主持，劉少奇就各地社教運動中反映出的一些問題，提請會議討論。

　　劉少奇說：“陶鑄同志有一封信給我，提出了一個農村新興的富裕階層，特貧階層的問題。還有一些地方提資產階級分子。農村里面用不用新資產階級分子這個名字？還是叫貪污犯分子，投機倒把分子？”

　　毛澤東說：“恐怕農民他不懂得什么叫資本主義。你講投機倒把，講貪污盜竊，他懂得。”

　　劉少奇又說：“看來，工作隊的骨干力量不夠分配，領導不很強。是不是戰線過長了？是不是需要縮短一些戰線？如何縮短？”

　　毛澤東說：“縮短容易嘛，你一縮就行了。”

　　劉少奇接著說：“有些地方提出，機關家屬里面很多惡霸、地主、富農、四類分子。這是一個普遍性的問題。”

　　毛澤東說：“也沒有那么多。全國人口幾億，那些人總之是什么幾百萬、千把萬嘛，又散在各地。清是要清，多是不多，有是有。”

　　從這段對話中可以看出，毛澤東對劉少奇提出的問題并不很熱心，且隱隱約約表現出對劉少奇有看法。

　　毛澤東對劉少奇的不滿情緒，在此之前也有所流露。

　　1964年11月底，一次聽取工作匯報時，毛澤東對劉少奇說：還是少奇掛帥，“四清”、“五反”、經濟工作，統統由你管。我是主席，你是第一副主席，天有不測風云，不然一旦我死了你接不上，現在就交班，你就做主席，做秦始皇。我有我的弱點，我罵娘沒有用，不靈了，你厲害，你就掛個罵娘的帥，你抓小平、總理。對于毛澤東突然提出這個問題，劉少奇并無準備，只得說：我搞不來這么多，“四清”我管，“五反”(謝)富治、彭真多管，經濟工作由小平、總理管。毛澤東說：還是你掛帥，小平做秘書長。他們這些人很忙，否則哪個也統不起來。

　　毛澤東說劉少奇“厲害”，也是事出有因。毛澤東曾一再要求干部下去蹲點，可有些干部就是不下去，他也似乎并沒有采取進一步的措施。而劉少奇負責“四清”一線工作后，為了改變這種狀況，對一些干部進行嚴厲批評。劉少奇還不止一次地講，不下去蹲點的干部，不能作省委書記、地委書記、縣委書記，不能當部長、當司局長，也不能當中央委員。他還對中央組織部部長安子文講過同樣的話。這樣一來，不長的時間，就有180多位正副部長、1000多名司局長離開機關下去蹲點了。劉少奇還講過，現在搞社教運動，過去搞調查研究的辦法不行，得學會扎根串聯。這樣的話傳到毛澤東的耳朵，也就難免產生某種不快了。

　　12月16日之后，會議是上午小組討論，下午舉行全體會議。兩年多的社教運動的結果，不但未能解決干部隊伍中存在的問題，反而發現形勢越來越嚴峻。在會上的發言中，中南局的陶鑄提出，領導權不在我們手中的三分之一打不住。西北局的劉瀾濤說，縣以上爛掉的有嚴重問題的在50%以上，基本形式是濫用職權，包庇壞人，反革命，自己可能是反革命。華北局的李雪峰說，情況愈摸愈嚴重，“四清”、“五反”如此。山西8個重點縣縣委，已爛掉3個，常委72人有問題的38人。浙江省第一書記江華則在給中共中央的一個報告中說，很多基層單位已經被壞人篡奪了領導權，其比例已不止三分之一。

　　12月20日下午，中共中央政治局常委會召開擴大會議，討論社會主義教育問題。會議開始時，毛澤東要劉少奇主持會議，劉少奇執意不肯。毛澤東就要劉少奇先講話。

　　劉少奇一開始就提出：農村當前的主要矛盾，究竟是富裕農民階層同廣大貧下中農的矛盾，還是原來提的地富反壞跟蛻化變質的有嚴重錯誤的壞干部結合起來同群眾的矛盾？

　　毛澤東說：地富反壞是后臺老板，“四不清”干部是當權派。農村的問題是這一批干部，騎在農民頭上，農民不好混，窮得要死。他又說：地主富農那些人，已經搞臭過一次了。至于這些當權派，從來沒有搞臭過。他又是共產黨，上面又聽他的。顯然，毛澤東認為這一次要解決的是這些“當權派”的問題。

　　劉少奇似乎沒有跟上毛澤東的認識，繼續說：對當權派，這是頭一仗。但他們后頭有地富反壞。

　　毛澤東說：漏劃地富變成中農，變成貧農，有的當了共產黨，因為他漏劃了。那也是一種當權派。

　　劉少奇又提出主要矛盾問題，毛澤東說：還是講當權派，他要多記工分，五大領袖嘛，五大領袖難道不是當權派？

　　毛澤東又說：不要管什么階級階層，只管這些當權派，共產黨當權派，五大領袖和跟當權派走的。不管你過去是國民黨共產黨，反正你現在是當權派。發動群眾就是整我們這個黨。中心問題是整黨，不整黨沒有希望。

　　毛澤東在講話中還提出：搞的結果，戶數不超過百分之七，人數不超過百分之十。他說：我提出這個問題有點右。我就是怕搞得太多了，搞那么多地主、富農、國民黨、反革命、和平演變的，劃成百分之十幾、二十，如果百分之二十，七億人口就有一億四，那恐怕要發生一個“左”的潮流。農民起來，紅了眼，影響到你們，你們走群眾路線嘛，就站到群眾那方面，結果樹敵太多，最后不利于人民。他還說：那些貪污幾十塊錢、一百塊錢、一百幾十塊錢的大多數四不清干部先解決，我們的群眾就多了。貪污一百塊錢到一百五十塊錢的解放出來，就解放了百分之八十。

　　劉少奇始終放不下主要矛盾問題，又將這個問題提了出來，并認為主要矛盾就是“四清”與“四不清”的矛盾。毛澤東答非所問地說了一句：不以人的意志為轉移。