一是蔣介石認為國民黨在大陸失敗的主要因素是黨的失敗。他在國民黨七大上作政治報告時曾沉痛地說：“這次大陸反共軍事悲慘的失敗，并不是共匪有什么強大的力量足夠打敗我們國民革命軍，完全是領導國民革命的本黨組織瓦解，紀綱廢弛，精神衰落，藩籬盡撤之所致。”所以，為了根除上述弊端，蔣介石認為必須對國民黨動大手術，來一番徹底的改造與重建。

　　二是蔣介石認為國民黨退臺后，組織渙散依舊，派系斗爭猶存。國民黨內派系傾軋由來已久。1927年第一次國共合作破裂后，國民黨政治的最大特征，就是派系爭斗。蔣介石慣用的伎倆是擴大和制造部屬之間的矛盾，然后利用這些矛盾分而治之。在蔣介石統治大陸的22年中，派系爭斗從未停止過。在財政上曾有孔祥熙與宋子文之間的爭斗；在軍事上曾有何應欽與陳誠之間的對立；在黨務方面曾有過陳氏兄弟與朱家驊之間、“CC”系與復興社之間及軍統與中統之間的相互傾軋。正如蔣介石所言：由于“黨內不能團結統一，同志之間、派系分歧，利害摩擦，違反黨紀、敗壞黨德，以至整個的黨，形成一片散沙，最后共黨乘機一擊，遂致全盤瓦解，徹底崩潰。”如果讓派系爭斗的局面繼續下去，“則黨必歸于毀滅，永無復興的希望”。蔣嘴上說要清除內耗現象，骨子里還是要借國民黨改造之機清除異己，使臺灣真正成為清一色的蔣家天下、蔣家黨。